Visi:

Menjadi Perguruan Tinggi Islam yang Unggul dan Terkemuka di Kepulauan Buton yang Memadukan Intelektual dalam  Akhlak bagi peradaban tahun 2035

Misi :

  1. Memadukan dan Mengembangkan studi keislaman, keilmuan dan akhlak dalam Pendidikan dan pengajaran.
  2. Mewujutkan Sekolah tinggi Islam yang mandiri, berdaya saing mereflesikan integrase antara ajaran islam, Ilmu Pengetahuan Tekhnologi.
  3. Meningkatkan dakwah dan budaya Ijtihad yang bermanfaat bagi kepentingan akademik dan masyarakat, cerdas spiritual, intelektual dan emosional.
  4. Mengembangkan pola pemberdayaan masyarakat religius dalam penyelesaian persoalan daerah berdasarkan wawasan keimanan, ilmu dan akhlak bagi terwujudnya masyarakat marhamah.

Tujuan :

  1. Menghasiskan sarjana yang menghargai dan menjiwai Nilai-nilai keislaman, keilmuan, akhlak dan kemanusiaan.
  2. Terciptanya Kampus STAI YPIQ Baubau sebagai pusat studi yang unggul dalam bidang kajian dan penelitian, pengembangan budaya lokal serta memiliki tanggung jawab social kemasyarakatan.
  3. Menghasilkan sarjana pengembang Dakwah yang memiliki ketahanan spiritual, kemampuan akademis dan kecakapan emosional.
  4. Menghasikan mahasiswa berkarakter pemimpin dan berjiwa wirausaha serta memiliki jaringan fungsional dan kokoh dengan para alumni.